Na základě výše uvedených ustanovení ústav sleduje kvalitu látek vstupujících do zemědělské půdy z důvodu ochrany potravinového řetězce a zdraví lidí. Mezi sledované látky jsou zahrnuty čistírenské kaly a sedimenty.
Základní okruhy činností Oddělení bezpečnosti práce v oblasti monitoringu vstupů do půdy:
- Aktivní biomonitoring
- Monitoring kvality kalů z ČOV a půd a rostlin po aplikaci kalů
- Monitoring atmosférické depozice
- Sledování rybničních a říčních sedimentů
