Ministerstvo zemědělství, jako správce programu 229 110 „Odstranění následků povodní na státním vodohospodářském majetku“, poskytuje finanční podporu – dotaci podle § 102 odst. 1. písm. f), k), n) zákona č. 254/2001 Sb., o vodách a o změně některých zákonů (vodní zákon), ve znění pozdějších předpisů, v rámci podprogramů:
229 116 – Odstranění následků povodně roku 2009
229 117 - Odstranění následků povodně roku 2010
Žadateli o podporu z programu jsou pouze správci vodních toků, tedy státní podniky Povodí (Labe, Moravy, Ohře, Odry, Vltavy) a Lesy České republiky, s.p. Podpora je účelově vázána a je poskytována na kapitálové i běžné výdaje. Náprava povodňových škod a obnova povodní poškozeného majetku je realizována neinvestičními i investičními opatřeními. Po ukončení realizace akcí dochází ke kontrole plnění hlavních ukazatelů při závěrečném vyhodnocení akcí a následně pak podprogramu podle příslušných vyhlášek MF, o účasti státního rozpočtu na financování programu reprodukce majetku. Naplňování podprogramů konkrétními akcemi je uskutečňováno postupně s ohledem na rozsah škod, ve vazbě na investorskou přípravu realizace jednotlivých akcí a s ohledem na efektivnost vynakládání finančních prostředků. Při posuzování priorit pro realizaci jednotlivých akcí se vychází z nutnosti urychleně odstranit povodňové škody tam, kde by odložení realizace opravy poškozeného státního majetku vytvářelo podmínky pro navýšení škod při jeho ohrožení dalšími povodněmi.
Podpora je administrována podle Závazných pravidel poskytování finančních prostředků v oblasti vod a způsobu kontroly jejich užití pro příslušný rok, které jsou každoroční přílohou zákona o státním rozpočtu.
